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生物學活性上，細菌內毒素的生物學活性多種多樣，特別是在機體內的表現，錯綜復雜，常相互聯系、促進或制約。在體內或特定的體外條件下，所表現出的活性，有時為多種活性綜合作用的結果。不同的實驗條件下，所得到的結果也不一致。其生物學活性大致有：致熱性，致使人和動物發熱，體溫升高;早期白細胞數量減少，后期白細胞數量明顯增加;引起血小板粘附、聚集、觸發凝血系統，導致彌漫性血管內凝血（disseminated intravascular coagulation;DIC）。具有激活凝血系統的作用；能激活補體活化的經典途徑，也能活化旁路途徑;可導致動物發生什瓦茨曼(shwartzman)現象;導致心肌損害、肺損傷、肝衰竭、腎衰竭、胃腸道損傷等多器官功能障礙;具有較強抗原性，能刺激機體產生相應抗體；具有免疫佐劑活性。此外，內毒素還能導致懷孕動物流產、早產或死胎;抑制紅細胞的生成;具有致敏和抗敏作用；刺激淋巴細胞有絲分裂;鯊細胞溶解物（鯊試劑）凝集；腫瘤細胞壞死作用等。